Миссия ПИМУ: Развитие отечественной медицины путём подготовки специалистов, способных обеспечивать оказание медицинской помощи на основе лучших мировых практик, разрабатывать и внедрять инновационные технологии сохранения и укрепления физического и психического здоровья путём интеграции образования, исследований и клинической практики.
Стратегическая цель - развитие ПИМУ, способствующее его продвижению в международных рейтингах университетов и выходу на лидирующие позиции национальных рейтингов, повышение качества образования, упрочение на ведущих позициях в области фундаментальных и прикладных научных биомедицинских исследований и разработок, ускорение коммерциализации научных знаний.